核酸標的低分子創薬研究分野 / 産研 / 大阪大学

RNA-低分子相互作用データベースの構築

結合スクリーニングにより得られた「RNA-低分子間相互作用情報」を、データベース化しています。AMEDプロジェクトでは、これまで内部ループ、ヘアピンループなどのRNAモチーフを RNA 3D Motif Atlasより抽出し、AMED参画の製薬企業から提供された低分子化合物を用いて、スクリーニングしてきました。これまで、200,000以上のデータセット(RNA×化合物)を取得しています。これらのデータを集約・整理し、検索可能なデータベースの構築を進めています。データベースの公開対象、公開範囲については、現在プロジェクト内で検討しているところです。

スクリーニングのイメージ図