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中谷 和彦
堂野 主税
柴田 知範
スタッフ
学生
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スタッフ
助教 柴田 知範
しばた とものり

shibata@ sanken.osaka-u.ac.jp

学  歴
平成20年 3月 高知大学理学部物質科学科 卒業
平成22年 3月 大阪大学大学院理学研究科化学専攻博士前期課程 修了
平成25年 3月 大阪大学大学院理学研究科化学専攻博士後期課程 修了

職  歴
平成23年 4月 日本学術振興会特別研究員 (DC2, 中谷和彦教授)
平成25年 4月 京都大学 iPS細胞研究所 特定研究員 (齊藤博英教授)
平成27年 7月 大阪大学 産業科学研究所 特任助教 (中谷和彦教授)
平成30年 4月 大阪大学 産業科学研究所 助教 (中谷和彦教授)

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論文リスト
Original Papers

(15) A small molecule binding to TGGAA pentanucleotide repeats that cause spinocerebellar ataxia type 31, Shibata, T.; Nakatani, K. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2022, 79, 129082. doi: 10.1016/j.bmcl.2022.129082.

(14) Short Tandem Repeat Contractions during in vitro DNA Synthesis by Repeat-Binding Molecules, Hagihara, M.; Dohno, C.; Saito, K.; Sugimoto, K.; Hishinuma, Y.; Sohma, Y.; Shibata, T.; Nakatani, K. Chem. Lett. 2021,50, 1848-1851. doi:10.1246/cl.210415.

(13) Small molecule targeting r(UGGAA)n disrupts RNA foci and alleviates disease phenotype in Drosophila model, Shibata, T.; Nagano, K.; Ueyama, M.; Ninomiya, K.; Hirose, T.; Nagai, Y.; Ishikawa, K.; Kawai, G.; Nakatani, K. Nat. Commun. 2021, 12, 236. https://doi.org/10.1038/s41467-020-20487-4.

(12) 1,3-Di(quinolin-2-yl)guanidine binds to GGCCCC hexanucleotide repeat DNA in C9ORF72. Shibata, T.; Murakami, E.; Nakatani, K. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2018, 28, 2364-2368, DOI: 10.1016/j.bmcl.2018.06.032.

(11) Bicyclic and tricyclic C-C mismatch-binding ligands bind to CCG trinucleotide repeat DNAs, Shibata, T.; Nakatani, K. Chem. Commun. 2018, 54, 7074-7077, doi: 10.1039/c8cc02393j.

(10) Protein-driven RNA nanostructured devices that function in vitro and control mammalian cell fate, Shibata, T.; Fujita, Y.; Ohno, H; Suzuki, Y.; Hayashi, K.; Komatsu, K. R.; Kawasaki, S.; Hidaka, K.; Yonehara, S.; Sugiyama, H.; Endo, M.; Saito, H. Nat. Commun. 2017, 8, 540. doi; 10.1038/s41467-017-00459-x.

(9) Fluorescence probe for detecting CCG trinucleotide repeat DNA expansion and slip-out, Shibata, T.; Nakatani, K. ChemBioChem. 2016, 17, 1685-1688. doi; 10.1002/cbic.201600200.

(8) A hybridisation-dependent membrane-insertable amphiphilic DNA, Dohno, C.; Matsuzaki, K.; Yamaguchi, H.; Shibata, T.; Nakatani, K. Org. Biomol. Chem. 2015, 13, 10117-10121. doi: 10.1039/C5OB01761K.

(7) Cytosine-bulge dependent fluorescence quenching for real-time hairpin primer PCR, Takei, F.; Chen, X.; Yu, G.; Shibata, T.; Dohno, C.; Nakatani, K. Chem. Commun. 2014, 50, 15195-15198. doi: 10.1039/c4cc06780k.

(6) Modulation of binding properties of amphiphilic DNA containing multiple dodecyl phosphotriester linkages to lipid bilayer membrane, Makishi, S.; Shibata, T.; Okazaki, M.; Dohno, C.; Nakatani, K. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2014, 24, 3578-3581. doi: 10.1016/j.bmcl.2014.05.042.

(5) G-quadruplex formation of entirely hydrophobic DNA in organic solvents. Shibata, T.; Dohno, C.; Nakatani, K. Chem. Commun. 2013, 49, 5501-5503. doi: 10.1039/c3cc42221f.

(4) Amphiphilic DNA duplex stabilized by hydrophobic zipper. Dohno, C.; Shibata, T.; Okazaki, M.; Makishi, S.; Nakatani, K. Eur. J. Org. Chem. 2012, 5317-5323. doi: 10.1002/ejoc.201200540

(3) Interstrand Cross-Link for Discrimination of Methylated Cytosines. Dohno, C.; Shibata, T.; Nakatani, K. Chem. Lett. 2011, 40, 852-854. doi: 10.1246/cl.2011.852

(2) Discrimination of N6-methyl adenine in a specific DNA sequence. Dohno, C.; Shibata, T.; Nakatani, K. Chem. Commun. 2010, 46, 5530-5532.

(1) Platinum (II) Complex-Catalyzed Enantioselective Aldol Reaction with Ketene Silyl Acetals in DMF at Room Temperature. Kiyooka, S.; Matsumoto, S.; Shibata, T.; Shinozaki, K. Tetrahedron 2010, 66, 1806-1816. doi: 10.1016/j.tet.2010.01.036

著書

(1) Folding RNA-protein complex into designed nanostructures. Shibata, T.; Suzuki, Y.; Sugiyama, H.; Endo, M.; Saito, H. 2015, 1316, 169-179. Methods Mol. Biol. 2015, 1316, 169−179.

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国際会議論文・Proceedingsなど

(1) DNA cross-link generated by a novel modified DNA containing a formyl group. Shibata, T.; Dohno, C.; Nakatani, K. (Oxford university press, Oxford, 2009) Nucleic Acids Symp. Ser., 2009, 53, 171−172.

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