第38回日本顕微鏡学会論文賞　応用研究（生物系） 和沢　鉄一, 野間　涼平, 宇土 周作, 杉浦　一徳, 鷲尾　隆 ,永井　健治, 2023,06,27

第15回中谷賞大賞
永井 健治, 2023.2.24

第25回産研国際シンポジウムポスター賞
野間 涼平, 2022.1.6

Real Tech Fund賞
細胞レベル分解能・高速超広視野イメージングの実現
チームAMATERAS, 2021.10.09

第21回山崎貞一賞 バイオ・医科学分野（2021年度）
高機能化学発光タンパク質の開発と応用展開
永井 健治, 2021

日経ウーマノミクス・プロジェクト 2021シンポジウム Are you ready? SDGsが拓く未来 SDGs座談会発表コンテスト 優秀賞
大阪大学産業学研究所「asiam -アザイム-」チーム
He yunting, 宇都宮 桜, 大井 彩裕美, 2021.07.13

第29回日本バイオイメージング学会学術集会ベストイメージング賞 ニコン賞
野間 涼平 [Photo], 2020.12.21

第35回（2020年度）日本顕微鏡学会論文賞　顕微鏡法基礎部門
和沢 鉄一, 新井 由之, 河原 吉伸, 高内 大貴, 鷲尾 隆, 永井 健治, 2020.07.04

第57回 日本生物物理学会年会 若手奨励賞
篠田 肇, 2019.09.26

Blue Flame Award from Addgene
永井 健治, 2018, 09.28

第36回 大阪科学賞
永井 健治, 2018.10.31

第3回 日本光生物学協会協会賞
永井 健治, 2018.08.09

20th International Symposium on Calcium Binding Proteins and Calcium Function in Health and Disease (CaBP20) Excellent Poster Award
Md. Nadim Hossain, 2017.10

第55回(平成29年)日本生物物理学会年会学生発表賞
篠田 肇, 2017.09.21

第39回(平成28年)日本分子生物学会年会優秀ポスター賞
稲垣 成矩, 2016.11.30

第54回(平成28年)日本生物物理学会年会学生発表賞
稲垣 成矩, 2016.11.27

大阪大学総長顕彰（平成27年度）
永井 健治, 2015.07.14

大阪大学総長奨励賞（平成27年度）
松田 知己, 2015.07.14

大阪大学総長顕彰賞（平成26年度）
永井 健治, 2014.07.08

大阪大学総長奨励賞（平成26年度）
松田 知己, 2014.07.08

大阪大学総長奨励賞（平成26年度）
新井 由之, 2014.07.08

第10回（平成25年度）日本学術振興会賞
永井 健治
発光性タンパク質エンジニアリングに基づく革新的バイオイメージング技術の開発, 2014.02.10

大阪大学総長顕彰受賞（平成25年度）
永井 健治, 2013.08.02

第21回（平成24年度）木原記念財団学術賞応用科学賞
永井 健治, 蛍光タンパク質エンジニアリングに基づく革新的バイオイメージング技術の開発, 2013.05.15